一番年上のお姉さんでミステリー小説が大好きな十二歳のハナ、『アメリカの科学』や『近代機械工学』といった雑誌を読むような、文明の利器に興味しんしんの十歳になる真ん中の男の子ザカリー、内気でおとぎ話が大好きな八歳の一番下の妹サラ・エミリーの三きょうだいは、母親の仕事の都合で、メイン州（アメリカにある州）の沖合の孤島にぽつんと建つ、マヒタベルおばさんの家で夏休みを過ごすことになった。

　マヒタベルおばさんは、もう、この島には住んでいない。今は、フィラデルフィアのアパートで暮らしている。

　マヒタベルおばさんから母親に手紙が届いた。島の家の合い鍵と、三きょうだいあてに特別なメッセージも同封されていた。

　三きょうだいが封筒を開けると、中から折りたたまれたメモ用紙と、柄が精巧な渦巻き模様で装飾された、小さな鉄の鍵が入っていた。鍵には「塔の部屋用」と書かれたラベルが結ばれていた。そして、メモ用紙には、
『もし、たいくつで時間をもてあますようなら、“ドレイクの丘”を調べることを、おすすめします』
と、書いてあった。

　孤島についた三きょうだいは、早速次の日ドレイクの丘を探検することにした。